चुनाव आयोग ने भोपाल में साध्वी प्रज्ञा के खिलाफ मामला दर्ज कराया चुनाव आयोग ने उनके खिलाफ समुदायों के बीच आपसी द्वेष और तनाव पैदा करने के लिए नोटिस देकर 24 घण्टे के भीतर जवाब मांगा था। इस पर साध्वी ने कहा था कि वह अपनी बात पर अडिग हैं। उन्होंने स्वीकार किया कि अयोध्या में ढाचा गिराने में वह भी शामिल थी। 
प्रज्ञा ने कहा वह फिर वहां जाएगी राम मंदिर बनाने में मदद करेंगी।  उन्हें ऐसा करने से कोई नहीं रोक सकता। आयोग ने उनके इस जवाब के बाद स्थिति का आकलन किया और साध्वी के जवाब पर गहरी नाराजगी जताई और  आयोग ने उनके खिलाफ आदर्श चुनाव आचार संहिता उल्लंघन में मामला दर्ज कर दंडात्मक कार्रवाई करने का आदेश जारी किया है।