मुख्यमंत्री सरमा का आरोप है कि गोगोई ने एक अनिर्दिष्ट वर्ष में 15 दिनों के लिए पाकिस्तान की यात्रा की, जो कथित रूप से आईएसआई के निमंत्रण पर की गई थी। साथ ही, उन्होंने दावा किया कि गोगोई ने 2015 में युवाओं के एक प्रतिनिधिमंडल को पाकिस्तान उच्चायोग, नई दिल्ली ले जाकर 'ब्रेनवॉश' करने की कोशिश की थी। यह यात्रा गोगोई द्वारा स्थापित संगठन यूथ फोरम ऑन फॉरेन पॉलिसी की पहल पर आयोजित की गई थी।
गौरव गोगोई ने इन आरोपों को "राजनीतिक बदनाम करने की साजिश" बताया और इसका कड़ा खंडन किया। उन्होंने कहा कि उस प्रतिनिधिमंडल ने कश्मीर, आतंकवाद और युद्ध जैसे मुद्दों पर पाकिस्तान के तत्कालीन उच्चायुक्त से तीखे सवाल किए थे। गोगोई ने तंज कसते हुए कहा,
"हम जिन्ना की प्रशंसा करने नहीं गए थे। हम नवाज शरीफ को जन्मदिन की शुभकामनाएं देने भी नहीं गए थे।"
उन्होंने लालकृष्ण आडवाणी की 2005 की पाकिस्तान यात्रा का हवाला देते हुए कहा कि
"आडवाणी जिन्ना की मजार पर गए थे, चादर चढ़ाई और उनकी प्रशंसा भी की थी।"
गोगोई ने प्रधानमंत्री नरेंद्र मोदी की 2015 की लाहौर यात्रा का भी ज़िक्र किया और 2014 में नवाज शरीफ की मोदी के शपथग्रहण समारोह में मौजूदगी को भी रेखांकित किया। उन्होंने सवाल किया, "अगर हमारा जाना अपराध है, तो मोदी का जाना बिरयानी कूटनीति कैसे हो गया?" गोगोई ने कहा कि यह जांच राजनीतिक रूप से प्रेरित है और इसका मकसद केवल उन्हें और उनकी पत्नी को बदनाम करना है।
"यह एसआईटी सच्चाई नहीं, सियासी एजेंडे पर आधारित है। बीजेपी सच्चाई नहीं, प्रचार में दिलचस्पी रखती है।"
