सीबीआई विवाद को लेकर कांग्रेस ने भाजपा और केंद्र सरकार पर हमला बोला है। कांग्रेस नेता मल्लिकार्जुन खड़गे ने दिल्ली में आयोजित एक प्रेस कॉन्फ्रेंस में सरकार पर गंभीर आरोप लगाए। उन्होंने कहा कि एक ऐसी कमिटी, जिसके पीएम अध्यक्ष हैं और सुप्रीम कोर्ट के मुख्य न्यायाधीश और नेता विपक्ष इसके सदस्य हैं। कमिटी ने सीबीआई चीफ को नियुक्ति दी है, लेकिन सरकार ने उन्हें हटाते वक्त कमेटी से पूछा तक नहीं।
सरकार को सीबीआई निदेशक का मामला कमिटी के सामने लाना चाहिए था।  सीवीसी पर भी भारी दबाव है। सरकार ने इस केस में अपनी मनमर्जी की है।सरकार को अपने घोटालों की वजह से नींद नहीं आ रही थी। उन्होंने रात में ही सीबीआई का खेल कर दिया। सरकार को गुस्सा आया कि सीबीआई चीफ राफेल घोटाले की शिकायत करने आए लोगों से क्यों मिले। आलोक वर्मा ने अरुण शौरी, प्रशांत भूषण का मेमोरेंडम सरकार से बिना पूछे क्यों लिया। अब वर्मा को इसी का खामियाजा भुगतना पड़ रहा है। उन्होंने सीबीआई प्रकरण को लेकर पीएम को पत्र लिखा है।